В ходе проверки установлены факты грубого нарушения ведения бухгалтерского учета, которые повлекли за собой искажение показателей бюджетной отчетности: баланса, отчета о финансовых результатах деятельности и сведений о движении нефинансовых активов. Значительная сумма нарушений связана с расходованием бюджетных средств на научно-исследовательские и опытно-конструкторские работы (НИОКР). Роскосмосом произведено необоснованное списание с балансов издержек на строительство шести космических аппаратов «ГЛОНАСС» в сумме 5,9 млрд. руб. Выявлены значительные нарушения при исполнении Роскосмосом бюджетных ассигнований на реализацию бюджетных инвестиций и предоставление субсидий на осуществление капитальных вложений в объекты недвижимого имущества. Кроме того, выявлены и другие серьезные нарушения. По итогам проверки принято решение направить представление в Федеральное космическое агентство, обращение — в Генеральную прокуратуру РФ, информационные письма — в Росстат и Росимущество, а также заключение — в Совет Федерации и Государственную думу РФ. Как сообщало ИА REGNUM, в конце мая — начале июня 2015 года Счетная палата РФ направила в Генпрокуратуру материалы о нарушениях в работе четырёх ведомств — министерства транспорта, министерства сельского хозяйства, министерства природных ресурсов и экологии и министерства культуры.
